根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二条规定，为了公共利益的需要，征收国有土地上单位、个人的房屋，应当对被征收房屋所有权人(被征收人)给予公平补偿。
第二十六条规定，被征收房屋所有权人不明确的，由房屋征收部门报请作出房屋征收决定的市、县级人民政府依照本条例的规定，按照征收补偿方案作出补偿决定，并在房屋征收范围内予以公告。
从这里可以看出，即使是产权不明确，为了公共利益需要也是可以进行征收的，而且相关的程序，补偿一样也不能少：
（1）在调查登记后发现特定房屋属于所有权不明状态的，应当将上述情况报告做出房屋征收决定的市、县级人民政府，房屋管理部门作出征收补偿安置方案。
（2）做出房屋征收决定的市、县级人民政府收到上述报请后，应当根据其已经做出的补偿方案，并根据专业房地产价格评估机构做出的房地产评估结果，制定出对征收产权不明的补偿决定，补偿决定应当体现公平原则。
（3）市、县级人民政府应当将对于所有权不明房屋的补偿决定在房屋征收范围内予以公告，公告的目的在于将房屋征收的情况告知房屋权利人，房屋权利人对补偿决定不服的，可以通过行政救济（行政复议）和司法救济（行政诉讼）的方式。
