犯本条所规定之罪的，处五年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利；情节严重的，处五年以上十年以下有期徒刑或者无期徒刑。情节严重一般是指担任重要职务的人叛逃的，携带国家秘密叛逃的，叛逃后发表有损中华人民共和国的言论的，等等。
掌握国家秘密的国家工作人员犯本罪的，依照上述规定从重处罚。
根据第56条和第113条的规定，犯本罪的，应当附加剥夺政治权利，可以并处没收财产。
《刑法》第一百零九条 【叛逃罪】国家机关工作人员在履行公务期间，擅离岗位，叛逃境外或者在境外叛逃的，处五年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利;情节严重的，处五年以上十年以下有期徒刑。
