1.批捕主体不同，检察机关的侦查部门是检察机关的侦查部门，检察检察部门是检察机关。
2.案件所处阶段有所不同。复审批捕是侦查机关(一般是公安机关)在立案侦查之后，对案件的基本事实有了一定的认识，认为犯罪嫌疑人符合逮捕条件，具有逮捕的必要，将案件移交检察院侦监科申请逮捕，并由检察院侦监科审查批捕后移交侦查机关继续侦查；审查起诉是侦查机关对案件侦查终结后移送公诉科的调查，检察机关的公诉科负责复审这些档案。
3.后果不同。
该案由检察院侦查科审查批捕后，其后果有两个，即批准逮捕犯罪嫌疑人或不予批准逮捕，案卷将移送侦查机关继续侦查；其结果也有两种，起诉或不起诉，如果是符合起诉条件的案件，经审查终结后，将移交人民法院提起公诉。
《刑事诉讼法》第一百零七条，公安机关或者人民检察院发现犯罪事实或者犯罪嫌疑人,应当按照管辖范围,立案侦查。
