计算违约金的起止时效是：从权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起开始计算，诉讼时效一般为三年；而权利受到损害超过二十年的，法院一般不保护。
《最高人民法院关于审理商品房买卖合同纠纷案件适用法律若干问题的解释》第十二条 当事人以约定的违约金过高为由请求减少的，应当以违约金超过造成的损失30％为标准适当减少；当事人以约定的违约金低于造成的损失为由请求增加的，应当以违约造成的损失确定违约金数额。
