特大交通事故的调查程序是这样的：
1、勘查事故现场，查明事故车辆、当事人、道路及其空间关系和事故发生时的天气情况；
2、固定、提取或者保全现场证据材料等；
3、询问当事人、证人并制作询问笔录；现场不具备制作询问笔录条件的，可以通过录音、录像记录询问过程。
《道路交通事故处理程序规定》第二十九条对发生一次死亡三人以上道路交通事故的，公安机关交通管理部门应当开展深度调查；对造成其他严重后果或者存在严重安全问题的道路交通事故，可以开展深度调查。具体程序另行规定。
