企业在管理其债权债务过程中的注意事项有：注意债权债务的诉讼时效是否已经过了；注意债权债务是否都有相应的证据证明；以及债权债务是否及时通过合法的方式得到了清偿和整理。
《中华人民共和国民事诉讼法》第六十七条 当事人对自己提出的主张，有责任提供证据。 第一百二十三条 起诉应当向人民法院递交起诉状，并按照被告人数提出副本。 第一百二十五条 当事人起诉到人民法院的民事纠纷，适宜调解的，先行调解，但当事人拒绝调解的除外。
