当事人对于著作权和商标权可以同时向有关部门进行申请的。根据我国著作权法的相关规定，著作权适用于已经完成的以有形形式体现的作品。而商标权适用于商品或者服务领域。二者有不同的部门法进行调整，但并不是互斥关系，故可以同时申请。
《中华人民共和国著作权法》第二条 中国公民、法人或者其他组织的作品，不论是否发表，依照本法享有著作权。 外国人、无国籍人的作品根据其作者所属国或者经常居住地国同中国签订的协议或者共同参加的国际条约享有的著作权，受本法保护。 《中华人民共和国商标法》第四条 自然人、法人或者其他组织在生产经营活动中，对其商品或者服务需要取得商标专用权的，应当向商标局申请商标注册。不以使用为目的的恶意商标注册申请，应当予以驳回。 本法有关商品商标的规定，适用于服务商标。
