被法院判处拘役三个月会有案底。拘役作为一种刑罚，代表着人民法院认定其有罪，因此是会留下案底的。案底一般指某人过去犯法或犯罪行为的记录，又称犯罪人员犯罪记录制度
《刑事诉讼法》第二百八十六条 犯罪的时候不满十八周岁，被判处五年有期徒刑以下刑罚的，应当对相关犯罪记录予以封存。犯罪记录被封存的，不得向任何单位和个人提供，但司法机关为办案需要或者有关单位根据国家规定进行查询的除外。依法进行查询的单位，应当对被封存的犯罪记录的情况予以保密。
