同工同酬与编制主要有以下区别：
1、编制属于人事关系，同工同酬属于劳动关系；
2、编制是由《事业单位人事管理条例》调整的，同工同酬是《劳动合同法》调整的；
3、编制的工资由多方面因素决定，同工同酬由工作量决定。
《劳动合同法》第十八条 劳动合同对劳动报酬和劳动条件等标准约定不明确，引发争议的，用人单位与劳动者可以重新协商；协商不成的，适用集体合同规定；没有集体合同或者集体合同未规定劳动报酬的，实行同工同酬；没有集体合同或者集体合同未规定劳动条件等标准的，适用国家有关规定。
