非法剥夺公民宗教信仰自由罪的立案标准为：本罪是行为犯，只要实施了非法剥夺公民宗教信仰自由的行为，原则上就构成犯罪。非法剥夺宗教信仰自由罪，是指国家机关工作人员非法剥夺公民的正当的宗教信仰自由，情节严重的行为。非法剥夺公民宗教信仰自由罪的主体是国家机关工作人员。
《中华人民共和国刑法》第二百五十一条 国家机关工作人员非法剥夺公民的宗教信仰自由和侵犯少数民族风俗习惯，情节严重的，处二年以下有期徒刑或者拘役。
