驾驶员只有6分又罚6分的处理是：只有6分又罚6分意味着已经被记满12分了，所以交警会扣留当事人的驾驶证，并通知当事人去进行理论学习并参加考试，考试通过之后，会发还驾驶证，不通过的，继续学习。
《机动车驾驶证申领和使用规定》第六十八条第一、二款 机动车驾驶人在一个记分周期内累积记分达到12分的，公安机关交通管理部门应当扣留其机动车驾驶证。 机动车驾驶人应当在十五日内到机动车驾驶证核发地或者违法行为地公安机关交通管理部门参加为期七日的道路交通安全法律、法规和相关知识学习。机动车驾驶人参加学习后，车辆管理所应当在二十日内对其进行道路交通安全法律、法规和相关知识考试。考试合格的，记分予以清除，发还机动车驾驶证；考试不合格的，继续参加学习和考试。拒不参加学习，也不接受考试的，由公安机关交通管理部门公告其机动车驾驶证停止使用。
