驾驶员肇事逃逸，保险公司不赔偿第三方责任保险。机动车交通事故责任强制保险不将逃逸作为免赔条款，但一般商业保险中的机动车第三方责任保险将逃逸作为免赔条款。因此，事故逃逸车辆的强制保险必须赔偿第三方的损失，商业三方保险应根据合同条款决定是否赔偿。
司机肇事逃逸，保险公司不赔偿第三方责任险。
根据《机动车交通事故责任强制保险条例》第二十二条有下列情形之一的，保险公司应当在机动车交通事故责任强制保险责任限额内预付救援费用，并有权向致害人追偿：
(1)驾驶员未取得驾驶资格或醉酒。
(2)被保险机动车被盗抢期间发生事故的。
（3）被保险人故意造成道路交通事故的。前款所列情形之一，发生道路交通事故，造成受害人财产损失的，保险公司不承担赔偿责任。机动车交通事故责任强制保险不以逃逸为免赔条款，但一般商业保险中的机动车第三方责任保险将以逃逸为免赔条款。因此，事故逃逸车辆的强制交通保险必须赔偿第三方的损失，商业三方保险应根据合同条款决定是否赔偿。
保险公司将交通肇事逃逸作为商业保险的免赔额。第三，免赔条款属于格式条款。根据《保险法》的规定，保险公司免除一方或限制一方责任的条款必须向投保人详细说明该条款的法律责任和后果，否则该条款无效。从您提供的案例中，只要证明车辆的投保人在投保时，商业保险公司没有详细说明免赔条款的法律责任和后果，交通事故免赔协议无效，保险公司应履行赔偿责任。
第二十二条保险公司在机动交通事故责任强制保险责任范围内支付抢救费用，并有权向致害人追偿：
(一)驾驶员未取得驾驶资格或醉酒；
(二)被保险机动车被盗抢时发生事故；
（3）被保险人故意造成道路交通事故的。
保险公司不承担前款一，发生道路交通事故，造成受害人财产损失的，保险公司不承担赔偿责任。
根据《中华人民共和国侵权责任法》第五十三条规定：机动车驾驶人发生交通事故后逃逸，该机动车参加强制保险的，由保险公司在机动车强制保险责任限额内予以赔偿。
