夫妻离婚时有两个孩子。如果一方同意两个孩子都由另一方抚养，法院将尊重双方达成的协议，一方将抚养两个孩子。如果双方对两个孩子的监护权存在较大争议，法院通常会从缓解家庭矛盾和公平的角度来判断一方抚养一个孩子的可能性更大。
当然，法院也会遵循未成年子女最大利益的原则，如果一方不适合抚养子女，如吸毒、赌博、艾滋病、梅毒等传染病，或其他严重疾病，或一方有家庭暴力，或虐待家庭成员，同时一方长期不履行抚养义务等，法院可以将两个孩子的监护权归一方。
【法律依据】
《民法典》第一千零八十四条，父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。
离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。
离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿
