交通事故残疾等级由合格的司法鉴定机构进行评估。交通事故残疾的残疾鉴定一般应在治疗结束或出院后半年进行，否则鉴定机构不予进行。法院可以在起诉后指定鉴定机构，也可以在起诉前委托律师事务所。
根据公安部《交通事故处理程序》第四十条第二款的规定，当事人因交通事故致残的，经治疗结束后，由合格的残疾评估机构对残疾等级进行评估。合格的检查、鉴定、评估机构应当向省人民政府公安交通管理部门备案，公安交通管理部门可以向当事人介绍合格的检查、鉴定、评估机构由当事人自行选择。
根据《道路交通事故管理办法》第四十二条的规定，交通事故当事人因交通事故而残疾并需要残疾鉴定的，必须在治疗结束后15天内以书面形式向处理交通事故的公安机关申请。
根据医院证明和公安部关于道路交通事故残疾评估的标准，公安机关将在收到残疾评估申请后30天内评估残疾等级。当事人不接受残疾评估的，可以在收到评估后15天内向上一级公安机关申请重新评估。上一级公安机关将在收到重新评估申请后30天内作出重新评估的决定。重新评估的结论将以书面形式通知申请人。根据规定，上一级公安机关重新评估的结论是最终决定。
《道路交通事故处理程序规定》第四十九条需要进行检验、鉴定的，公安机关交通管理部门应当按照有关规定，自事故现场调查结束之日起三日内委托具备资质的鉴定机构进行检验、鉴定。尸体检验应当在死亡之日起三日内委托。对交通肇事逃逸车辆的检验、鉴定自查获肇事嫌疑车辆之日起三日内委托。对现场调查结束之日起三日后需要检验、鉴定的，应当报经上一级公安机关交通管理部门批准。对精神疾病的鉴定，由具有精神病鉴定资质的鉴定机构进行。
