1.土地的性质是不同的。拆迁房屋由政府统一划分，属于国有土地；小产权房屋未经国家正式程序批准，占用农村集体土地建设。
2.产权的性质是不同的。拆迁房屋有产权证明，或者未来拆迁协议可以办理产权证明，小产权房屋无产权证明，或者其产权证明由乡镇政府颁发，不得经房屋管理局批准。
3.上市和交易是否不同。有房产证的拆迁房可以像商品房一样在二手房市场交易，而小产权房则不能，交易有风险。
4.抵押贷款是否不同。有房产证的拆迁房屋也可以像商品房一样抵押，而小产权房屋不能在银行抵押。拆迁房屋是否可以直接转让和更名，主要取决于拆迁房屋是否有房产证。有房产证的拆迁房屋可以正常转让和更名，没有房产证的拆迁房屋不能更名。
根据《城市房地产管理法》第五条，房地产权利人应当遵守法律和行政法规，依法纳税。房地产权利人的合法权益受法律保护，任何单位和个人不得侵犯。
