银行在办理结算和支付中用以清讫双边或多边债权债务的过程和方法所使用的系统。按地域划分，清算系统分为国内联行清算和国际清算系统。
常见的清算模式有实时全额清算、净额批量清算、大额资金转账系统及小额定时清算四种模式。
(一)国内联行清算系统
国内联行清算根据交易行是否属于同一银行分为系统内联行清算和跨系统联行往来。同一家银行的总、分、支行间彼此互称联行往来。系统内联行清算包括全国联行往来、分行辖内往来和支行辖内往来。
跨系统联行往来是指结算业务发生在两家不同的银行间的清算业务。跨系统往来的资金清算必须通过中国人民银行办理。
(二)中国现代化支付系统
中国人民银行利用现代计算机技术和通信网络开发建设了中国现代化支付系统，包括：
(1)大额实时支付系统(HVPS)。处理同城和异地跨行之间和行内的大额贷记及紧急小额贷记支付业务，中国人民银行系统的贷记支付业务以及即时转账业务等。支付指令实时处理，全额清算资金。
(2)小额批量支付系统(BEPS)。处理同城和异地纸凭证截留的商业银行跨行之间的定期借记支付业务，中国人民银行会计和国库部门办理的借记支付业务，以及每笔金额在规定起点以下的小额贷记支付业务。批量发送支付指令，轧差净额清算资金。
其中同城票据交换，人民币同城票据交换每天2场，上午一场，下午一场。每年的12月31日这一天，人民币票据交换增加到三场。
外币同城票据交换一天一场，每年的12月31日这一天，外币票据交换增加到二场。
