亲子鉴定有以下三种方法：
（一）血型测试
这是最传统的方式。一般孩子6个月以上才可以做，并需要大量的血液样本。这种方法过程烦琐、取样痛苦且错误率高。传统的血型判断在一定程度上有其作用，但亲子鉴定并不能按照血型来鉴定。
（二）DNA亲子鉴定测试
DNA亲子鉴定是通过人体任何组织取样（例如口腔上皮细胞取样），也可以在孩子未出世前进行。
该方法是目前亲子测试中最准确的一种--准确率可达99.99999%，具有精巧、简便、快速、经济、实用的特点。父子关系相对机会（RCP），按照国内外亲子鉴定的惯例，当RCP值大于99.73%时，则可以认为假设父与孩子具有亲生关系。
（三）SNP检测
当前DNA亲子鉴定利用人类基因组中的重复碱基序列（STR作为第二代分子标记）和PCR技术进行个体识别，但STR具有很大的局限性，SNP是第三代分子标记技术，是将来的发展方向。
