合作开发合同当事人应当履行以下主要义务：
一、按照合同的约定进行投资，包括以技术进行投资。共同投资是合作开发合同的重要特征，也是合作开发合同各方当事人的主要义务。这里的投资，是指合作开发合同当事人以资金、设备、材料、场所、试验条件、技术情报资料、专利权、技术秘密成果等方式对研究开发项目所作的投入。采取资金以外的形式进行投资的，应当折算成相应的金额，明确当事人在投资所占的比例。
二、按照合同约定的分工参与研究开发工作。参与研究开发工作是合作开发合同的特征。参与研究开发工作，包括按照约定的计划和分工分别承担设计。工艺、试验、试制等研究开发工作。当事人一方提供资金、设备、材料等物质条件，承担辅助协作事项，另一方进行研究开发工作的合同，不属于合作开发合同，应当按委托开发合同处理。
三、协作配合研究开发工作。合作开发各方在研究开发中的配合是取得研究开发成果的关键。合作各方可以在合同中约定成立由双方代表组成的指导机构，对研究开发工作中的重大问题进行决策。协调和组织研究开发活动，保证研究开发工作的顺利进行。
合同开发合同的当事人违反约定造成研究开发工作停滞、延误或者失败的，应当承担违约责任。
