夫妻之间分居协议是可以进行公证的，但是并不是必须进行公证。分居协议原则上一经签字即为生效，但在现实生活中，很多当事人签订分居协议希望能以公证、律师见证等正规形式确认下来。实践中，几乎所有公证处都没有将分居协议明确列入民事协议公证的范围。
《中华人民共和国公证法》第十一条根据自然人、法人或者其他组织的申请，公证机构办理下列公证事项：合同、财产分割、婚姻状况、亲属关系、收养关系、文书上的签名、印鉴、日期、文书的副本、影印本与原本相符等内容可以进行公证。
