由于土地承包经营权的价值是土地所有权价值的一部分，土地承包经营权的征地补偿标准应当遵循与土地所有权相同的原则，以实现对所有权人和利益所有者的公平保护。目前，我国集体土地所有权补偿采用区域综合价格或年产值标准，未来由省政府根据当地土地资源条件、土地产值、土地位置、土地供求关系、社会经济发展水平等综合因素确定。
因此，土地承包经营权征地补偿标准应由地方政府在综合评价投资成本、经营成本、预期收入等要素的基础上，核实土地承包经营权在土地所有权中的比例，土地承包经营权人和所有人按批准比例分别赔偿，承包人取得地上附着物和幼苗补偿的，应当在批准比例内扣除利益。
根据《土地管理法》第四十八条第三款规定，征收农用地的土地补偿费、安置补助费标准由省、自治区、直辖市通过制定公布区片综合地价确定。制定区片综合地价应当综合考虑土地原用途、土地资源条件、土地产值、土地区位、土地供求关系、人口以及经济社会发展水平等因素，并至少每三年调整或者重新公布一次。
《中华人民共和国民法典》第三百三十八条 【承包地的征收补偿】承包地被征收的，土地承包经营权人有权依据本法第二百四十三条的规定获得相应补偿。
第二百四十三条 【征收】为了公共利益的需要，依照法律规定的权限和程序可以征收集体所有的土地和组织、个人的房屋以及其他不动产。
征收集体所有的土地，应当依法及时足额支付土地补偿费、安置补助费以及农村村民住宅、其他地上附着物和青苗等的补偿费用，并安排被征地农民的社会保障费用，保障被征地农民的生活，维护被征地农民的合法权益。
《中华人民共和国土地管理法实施条例》第二十五条第三款市、县人民政府土地行政主管部门根据经批准的征收土地方案，会同有关部门拟订征地补偿、安置方案，在被征收土地所在地的乡（镇）、村予以公告，听取被征收土地的农村集体经济组织和农民的意见。征地补偿、安置方案报市、县人民政府批准后，由市、县人民政府土地行政主管部门组织实施。
