存栏禽畜的出清补偿，一般是结合禽畜的种类、大小、市场价格来确定，如仔猪多少钱一头，母猪多少钱一头，种猪多少钱一头，有一头算一头，有一只算一只，清点树木，确定价格之后，算出补偿金额。养殖拆迁，土地补偿归土地使用权人，养殖评估后的费用归实际承包人，双方之间另有约定的，按照约定办理。如果认为补偿不合理，可通过诉讼途径处理。农村养殖场拆迁，一定是要给予农户相应的补偿，但是，不是在任何情况下农户都能获得补偿，农村养殖场拆迁获得合理补偿的前提是必须要合法经营;养殖相关的经营证照等都要齐全、环评手续等要符合规定。
根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》第十七条，作出房屋征收决定的市、县级人民政府对被征收人给予的补偿包括：
1.被征收房屋价值的补偿；
2.因征收房屋造成的搬迁、临时安置的补偿；
3.因征收房屋造成的停产停业损失的补偿。
