如果手续合法的话就应该按照营业性质的房产进行补偿，各地的住改商房屋补偿政策采用了不同的模式，就房屋的补偿而言，大多数地方按照住宅房屋与非住宅房屋的加权平均值确定，即高于普通住宅低于正规商铺的补偿。
《城市房屋拆迁管理条例》第十五条，拆迁补偿安置协议订立后，被拆迁人或者房屋承租人在搬迁期限内拒绝搬迁的，拆迁人可以依法向仲裁委员会申请仲裁，也可以依法向人民法院起诉。诉讼期间，拆迁人可以依法申请人民法院先予执行。
