(一)罪和非罪。
1.区分罪与非罪的界限，主要取决于情节是否严重。还没有达到严重性的，不应被视为犯罪，构成犯罪，而且仅限于追究主要分子和其他积极参与者的责任。对于一般参与者，可酌情进行批评教育或适当违法处理。
2.本罪和群殴的界限。由于领导有主动性，对涉及群众利益的事情处理得不好，或工作失误，使群众闹事，主要是靠改进工作和说服教育，而不是用犯罪论处。但是，对借助于群众闹事，鼓动群众，提出无理要求，破坏正常秩序，符合第290条规定的，应当依法追究其刑事责任。
(二)这一罪行与彼罪行和妨碍公务罪之界限。其不同之处是：
(1)侵权行为不同。这一罪行的对象是国家机关，而后者则是针对那些在法律上履行职责的国家工作人员。
(2)犯罪方法不同。此种犯罪可采用暴力.威胁法或非暴力无威胁性手段，如诱骗性；后者一般仅限于使用暴力.威胁法。
(3)犯罪形式不同。这种犯罪需要聚众形式，而非要求聚众形态。如聚众冲击国家机关，则属违法行为，将导致国家机构的正常活动不能继续进行，如果造成了非常严重的后果，那就必须对组织者首要分子处以5年至10年有期徒刑。
《中华人民共和国刑法》
第二百九十条【聚众扰乱社会秩序罪】聚众扰乱社会秩序，情节严重，致使工作、生产、营业和教学、科研、医疗无法进行，造成严重损失的，对首要分子，处三年以上七年以下有期徒刑;对其他积极参加的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利。【聚众冲击国家机关罪】聚众冲击国家机关，致使国家机关工作无法进行，造成严重损失的，对首要分子，处五年以上十年以下有期徒刑;对其他积极参加的，处五年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利。【扰乱国家机关工作秩序罪】多次扰乱国家机关工作秩序，经行政处罚后仍不改正，造成严重后果的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制。【组织、资助非法聚集罪】多次组织、资助他人非法聚集，扰乱社会秩序，情节严重的，依照前款的规定处罚。
